北海道
国立アイヌ民族博物館———民族
川村カ子トアイヌ記念館———民族
平取町立二風谷アイヌ文化博物館———民族
八雲町木彫り熊資料館———芸術・文学
三笠市立博物館———総合
オホーツク流氷館———自然
北のアルプ美術館———芸術・文学
渡辺淳一文学館———芸術・文学
北海道大学総合博物館———総合
青森
青森県立美術館———芸術・文学
立佞武多の館———生活
棟方志功記念館———芸術・文学
岩手
鉄の歴史館———歴史
奥州市牛の博物館———自然
宮城
地底の森ミュージアム———自然
秋田
なまはげ館———生活
山形
天童市将棋資料館———生活
福島
いわき市アンモナイトセンター———自然
茨城
水戸芸術館 現代美術ギャラリー———芸術・文化
地図と測量の科学館———科学・技術
栃木
おもちゃのまちバンダイミュージアム———生活
群馬
高崎市山田かまち美術館———芸術・文化
埼玉
さいたま市大宮盆栽美術館———芸術・文化
千葉
航空科学博物館———科学・技術
東京
国立科学博物館———総合
インターメディアテク———総合
東京大学総合研究博物館———総合
宇宙ミュージアムTeNQ———科学・技術
東京大学農場博物館———科学・技術
東京理科大学 数学体験館———科学・技術
國學院大學博物館———歴史
「食と農」の博物館・バイオリウム———生活
武蔵野音楽大学楽器ミュージアム———芸術・文化
駒澤大学禅文化歴史博物館———歴史
文化学園服飾博物館———生活
大妻女子大学博物館———生活
早稲田大学演劇博物館———芸術・文化
東京工業大学博物館———科学・技術
豊島区立トキワ荘マンガミュージアム———芸術・文化
木組み博物館———生活
目黒寄生虫館———自然
板橋区立美術館———芸術・文化
Bunkamura ザ・ミュージアム———芸術・文化
国立西洋美術館———芸術・文化
東京国立博物館———総合
葛飾柴又寅さん記念館———生活
TAKAO 599 MUSEUM———自然
長谷川町子美術館———芸術・文化
新宿区立漱石山房記念館———芸術・文化
三菱一号館美術館———芸術・文化
サントリー美術館———芸術・文化
アーティゾン美術館———芸術・文化
印刷博物館———生活
日本科学未来館———科学・技術
国立公文書館———生活
神奈川
海上保安資料館横浜館———生活
馬の博物館———自然
新潟
フォッサマグナミュージアム———生活
石川
宇宙科学博物館コスモアイル羽咋———科学・技術
柳宗理記念デザイン研究所———芸術・文化
福井
福井県立恐竜博物館———自然
福井県年縞博物館———自然
越前がにミュージアム———生活
福井県立若狭歴史博物館———歴史
山梨
山梨県立考古博物館———歴史
北杜市考古資料館———歴史
釈迦堂遺跡博物館———歴史
清泉寮やまねミュージアム———自然
フジヤマミュージアム———芸術・文化
長野
井戸尻考古館——歴史
茅野市尖石縄文考古館———歴史
蜂天国———自然
鬼無里ふるさと資料館———生活
野尻湖ナウマンゾウ博物館———自然
松本市美術館———芸術・文化
田淵行男記念館———芸術・文化
市立大町山岳博物館———自然
碌山美術館———芸術・文化
岐阜
多治見市モザイクタイルミュージアム———生活
静岡
東海大学海洋科学博物館———自然
まぼろし博覧会———総合
龍ちゃんのカッパ館———生活
土肥金山（黄金館）———歴史
ふじのくに茶の都ミュージアム———生活
愛知
昭和日常博物館———歴史
トヨタ博物館———科学・技術
三重
鳥羽市立 海の博物館———自然
滋賀
海洋堂フィギュアミュージアム黒壁 龍遊館———生活
京都
漢字ミュージアム———生活
日本の鬼の交流博物館———生活
平等院ミュージアム鳳翔館———歴史
大阪
国立民族学博物館———民族
大阪中之島美術館———芸術・文化
カップヌードルミュージアム大阪池田———生活
大阪市立自然史博物館———自然
兵庫
神戸ファッション美術館———芸術・文化
竹中大工道具館———生活
奈良
ならまち糞虫館———自然
奈良金魚ミュージアム———自然
和歌山
太地町立くじらの博物館———自然
鳥取
水木しげる記念館———芸術・文化
島根
仁摩サンドミュージアム———自然
奥出雲たたらと刀剣館———芸術・文化
岡山
奈義町現代美術館———芸術・文化
S-HOUSE Museum———芸術・文化
大原美術館———芸術・文化
招き猫美術館———芸術・文化
広島
海上自衛隊呉史料館（てつのくじら館）———科学・技術
山口
豊田ホタルの里ミュージアム———自然
岩国シロヘビの館———自然
土井ヶ浜遺跡・人類学ミュージアム———歴史
中原中也記念館———芸術・文化
徳島
阿波おどり会館———生活
香川
ベネッセハウス ミュージアム———芸術・文化
地中美術館———芸術・文化
杉本博司ギャラリー 時の回廊———芸術・文化
ヴァレーギャラリー———芸術・文化
マルキン醤油記念館———生活
平賀源内記念館———歴史
愛媛
タオル美術館———芸術・文化
高知
四国自動車博物館———科学・秘術
隈研吾の小さなミュージアム———芸術・文化
高知県立牧野植物園———自然
福岡
TOTOミュージアム———生活
北九州市漫画ミュージアム———芸術・文化
福岡市美術館———芸術・文化
佐賀
中冨記念くすり博物館———生活
長崎
音浴博物館———生活
軍艦島デジタルミュージアム———歴史
熊本
阿蘇火山博物館———自然
大分
天領日田洋酒博物館———生活
鯛生金山地底博物館———自然
宮崎
国際うなぎLABO———自然
鹿児島
日本マンダリンセンター———自然
かごしま近代文学館———芸術・文化
沖縄
ハブ博物公園 ———自然
