顏色、形狀、大小等獨一無二，散發出珍奇魅力的是自然物。這是一個擁有許多私人收藏家的領域，但只有在博物館，您才能面對巨大，條件良好，價值極高的“國寶級”標本，特別是化石和礦物。
從國內發掘的古代生物的實物化石，到日本屈指可數的綜合博物館收藏的充滿魄力的國產礦物。同時也投射出館長和館員的興趣和嗜好的名品和珍品，請務必親眼確認。
足寄動物化石博物館
阿紹洛亞實物化石
在遠古北海道繁盛的神秘哺乳類
位於北海道中東部的足寄町是被稱為束柱類的海棲哺乳類化石的一大產地。其中棲息於約2800萬年前，被認為是世界最古老的束柱類的阿紹洛亞的實物化石是必看的。
「這個館除了在足寄發現的化石之外，還展示了很多束柱類的代表劍龍的復原骨架，可以看到幾乎所有的束柱類物種，非常值得一看。」
束柱類的復原骨架。主要在水中度過。足寄動物化石博物館收藏 
開館於1998年。
城西大學水田紀唸博物館大石化石畫廊
貝蘭托塞亞實物化石
長著大魚鰭的體型奇怪的軟骨魚
從東京大學名譽教授大石道夫收集的約200件實物化石收藏品中，可以找到生活在約3億年前的軟骨魚貝蘭托西亞的化石。
「我被一個奇怪的體形所吸引，有一個大鰭，類似於我們想象的鯊魚等軟骨魚，但不相似。當我看到與現有生物完全不同的古代生物時，我的心在進化中變得更熱」
所有化石都是真實的。 
開館於2013年。腔棘魚化石的種類也很豐富。
國立科學博物館
山梨縣甲府市產日式孿晶
壓軸尺寸透明心形水晶
雙晶是由相同類型的礦物質以一定角度粘合而成的。其中昭和20年代在山梨縣甲府市八幡山出產的是這種巨大的石英日式孿晶。
「據說是水晶挖掘名人藤原利幸收藏的礦物，高20cm左右附帶母巖。這個大小和透明度之高是獨一無二的，作為國寶級的國產礦物是不能錯過的名石。」
收藏了幾乎所有的日本產礦物種類的標本，其數量在3萬件以上。 
創立於1877年。
京都大學綜合博物館
市之川產輝安礦 (比企收藏)
日本在世界上引以為豪的礦石礦物的躍動美
輝安礦是散發銀白色光澤的柱狀結晶。從愛媛縣市之川礦山開採出來的標本，其大小之美堪稱世界第一，其中這個博物館的標本保存狀態特別好，質量也特別高。
「國產金屬礦物的代表是市之川產輝安礦。由於名氣太大，很多優良標本都流落到了國外，在這種情況下，它是日本為數不多的大型標本中的佼佼者。」
以京都大學的研究成果為基礎的常設展示很有魅力。 
開館於2001年。
玄武洞博物館
亞馬遜石
引起全美話題的鮮艷的巨大礦物
鮮艷的綠色引人註目的巨大亞馬遜石群晶。它是在美國科羅拉多州生產的，當它被發現時，它似乎在全國範圍內引起了一個大話題，因為它的大小和美麗。
「這個亞馬遜石在礦物愛好者中以世界級標本而聞名。尺寸和狀態都很出眾，即使不是狂熱愛好者也想一看的寶獅性名品。」
收藏了約4,000件稀有礦物和化石。玄武洞博物館收藏 
建築物以玄武巖的六角形為形象。
